Filogenetski Tree & Lajmska bolest

Lajmska bolest jeboljka uzrokovana bakterijom Borrelia burgdorferi ,patogena prenosi blacklegged krpelja . Kao i kod mnogih drugih patogena , biolozi su bili u mogućnosti da se rasplesti malo evolucijske povijesti B. burgdorferi je kroz genetske analize . Phylogenetic stablo za bakterije poput B. burgdorferi daje vizualnu sliku svojih odnosa s drugim sojevima i vrsta . Filogenetske Stabla

filogenetskih stabala pokazuje evolucijske odnose između različitih vrsta . Svaki " čvor " na stablu predstavljapojava nove vrste , i ako se dvije vrste mogu pratiti svoje podrijetlo unatrag do jednog čvora , ovaj čvor predstavlja zadnju točku u vremenu koje ove dvije vrste dijelili zajedničkog pretka . Ova stabla su izgrađene na temelju fizičkih i genetskih osobina , i evolucijski biolozi su često prisiljeni promijeniti ih , kada novi podaci u pitanju svjetla .
Borrellia

Borrellia je zapravo rod bakterija koja uključuje više vrsta . Broj vrsta Borrelia je porasla više puta u protekla dva desetljeća kao što su bili identificirani više sojeva . Definiranje vrsta Borreliom ili bilo koji drugi rod bakterija je zapravovrlo lukav problem. Gdje su biljke i životinje u pitanju , biolozi su tradicionalno definirana vrsta na temelju njihove nesposobnosti za uzgoj i proizvodnju plodno potomstvo . Konj i magarac može uzgajati , na primjer , alimazga koja rezultira je sterilan , pa konji i magarci su zasebna vrsta . Bakterije , međutim , razmnožavaju aseksualno , tako da je ova definicija je nebitno . Prema tome , za Borreliom i za mnoge druge bakterije , mikrobiologa definirati vrste za razliku temelji se na tehniku ​​cijeli DNA-DNA hibridizacije .
Odnosi

Znanstvenici imaju izgrađene filogenetske stabala za Borrelia vrstama na temelju tehnikom zvanom multilocus analiza sekvenci ( MLSA ) koja promatra razlike između pojedinih " domaćinstva " gene prisutne u svim različitim vrstama . Biolozi koristiti ovaj softver za izgradnju " većina škrt stablo " -Phylogenetic stabla koja zahtijeva najmanji broj evolucijskih promjena objasniti uočene razlike . Rezultati ovog postupka, međutim , često moraju biti rafiniran , kada postanu dostupne nove informacije .

Odnosi

Trenutno , B. burgdorferi sensu stricto dijeli svoj najnoviji zajedničkog pretka B. bissettii ; ove dvije pak imaju zajedničkog pretka s B. lusitaniae . Sve tri vrste razišli od zajedničkog pretka dijele s B. afzelii , B. spielmanii , B. garinii i B. bavariensis . Ova skupina vrsta pak razišli od zajedničkog pretka zajedničko s B. valaisiana . Važno je imati na umu , međutim , da je ovaj filogenetskih stabala mogao vrlo dobro promijeniti u budućnosti , kao novi podaci dolazi na vidjelo . Konkretno , to je sasvim moguće da sesmanjuje trošak sekvenciranje genoma moglo utjecati na način na koji su filogenetske stabala razvijen za bakterije poput B. burgdorferi .